Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNEQ9Y223 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNEQ9Y223 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms