Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAF8Q9UPN6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCAF8Q9UPN6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms