Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSEQ9UL01 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DSEQ9UL01 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSEQ9UL01 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSEQ9UL01 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSEQ9UL01 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSEQ9UL01 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms