Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJD2Q9UKL4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms