Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP8AP2Q9UKL3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms