Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHIC2Q9UKJ5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CHIC2Q9UKJ5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms