Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDC42EP3Q9UKI2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDC42EP3Q9UKI2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms