Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN3Q9UKA8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RCAN3Q9UKA8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN3Q9UKA8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN3Q9UKA8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN3Q9UKA8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN3Q9UKA8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN3Q9UKA8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN3Q9UKA8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN3Q9UKA8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN3Q9UKA8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN3Q9UKA8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms