Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FBXL4Q9UKA2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms