Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MID2Q9UJV3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MID2Q9UJV3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms