Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RIMS3Q9UJD0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms