Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLXNA1Q9UIW2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLXNA1Q9UIW2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms