Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX2Q9UBZ4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX2Q9UBZ4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms