Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
C9orf78Q9NZ63 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C9orf78Q9NZ63 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms