Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLCO1C1Q9NYB5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLCO1C1Q9NYB5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms