Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf109Q9NX04 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf109Q9NX04 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf109Q9NX04 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf109Q9NX04 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf109Q9NX04 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf109Q9NX04 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf109Q9NX04 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf109Q9NX04 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf109Q9NX04 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf109Q9NX04 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf109Q9NX04 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C1orf109Q9NX04 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
C1orf109Q9NX04 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms