Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
INTS9Q9NV88 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
INTS9Q9NV88 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms