Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC6A13Q9NSD5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms