Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOMER3Q9NSC5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms