Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS4Q9NQG7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS4Q9NQG7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS4Q9NQG7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS4Q9NQG7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS4Q9NQG7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPS4Q9NQG7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HPS4Q9NQG7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms