Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA4BQ9NPR2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA4BQ9NPR2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms