Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
SLCO1B3Q9NPD5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLCO1B3Q9NPD5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms