Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELP3Q9H9T3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms