Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EPHX3Q9H6B9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EPHX3Q9H6B9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms