Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC113Q9H0I3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC113Q9H0I3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms