Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2J2Q9GZM3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2J2Q9GZM3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms