Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTR3CQ9C0K3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms