Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
KLHL4Q9C0H6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLHL4Q9C0H6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms