Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AMBRA1Q9C0C7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMBRA1Q9C0C7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms