Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NLRP1Q9C000 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NLRP1Q9C000 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms