Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FANCD2Q9BXW9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FANCD2Q9BXW9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FANCD2Q9BXW9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms