Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNG6Q9BXT2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG6Q9BXT2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms