Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IFT27Q9BW83 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFT27Q9BW83 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms