Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf50Q9BV19 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf50Q9BV19 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf50Q9BV19 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf50Q9BV19 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf50Q9BV19 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf50Q9BV19 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf50Q9BV19 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf50Q9BV19 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf50Q9BV19 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf50Q9BV19 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf50Q9BV19 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf50Q9BV19 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C1orf50Q9BV19 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1orf50Q9BV19 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms