Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AGMATQ9BSE5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGMATQ9BSE5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms