Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NIPSNAP3BQ9BS92 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms