Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LARP6Q9BRS8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LARP6Q9BRS8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms