Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
RIOK1Q9BRS2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIOK1Q9BRS2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms