Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPOCK3Q9BQ16 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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