Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABCA3Q99758 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCA3Q99758 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms