Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD27Q96NW4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD27Q96NW4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms