Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNDC3BQ96NL0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms