Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COG8Q96MW5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms