Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP57Q96MR6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP57Q96MR6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms