Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZNF488Q96MN9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ZNF488Q96MN9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms