Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDLIM2Q96JY6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms