Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMX3Q96JJ7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMX3Q96JJ7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms