Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF6Q96J87 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF6Q96J87 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF6Q96J87 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF6Q96J87 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF6Q96J87 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF6Q96J87 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CELF6Q96J87 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF6Q96J87 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF6Q96J87 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF6Q96J87 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CELF6Q96J87 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CELF6Q96J87 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF6Q96J87 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF6Q96J87 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF6Q96J87 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CELF6Q96J87 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms