Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LTV1Q96GA3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LTV1Q96GA3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms