Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX21Q969T3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX21Q969T3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms